![]() | Viață din bucățivezi toate articolele de Mihnea Bostina27 May 2010 la 05:44 13 comentarii 671 vizualizari. |
Vilva mare in ultima saptamina, de cind revista Science a anuntat ca Craig Venter a creat prima forma sintetica de viata.
Si cum nu iese vilva fara exagerari, s-a exagerat pe masura. Pe de o parte s-au exagerat pericolele pe care o astfel de tehnica le ridica. Pe de alta, s-a exagerat importanta acestui rezultat. La exagerari s-au adaugat uneori unele inexactitati tehnice – ca sa folosim un eufemism elegant. Si toate acestea au fost prezentate intr-un numar cit mai mic de semne tipografice.
Stirea e suficient de interesanta stiintific, de revolutionara tehnic si promtiatoare economic incit sa merite citeva precizari. Mai inghesui asadar si eu la ceea ce s-a scris 10 observatii: unele importante, altele doar amuzante si altele personale.
1. Vestea plutea in aer de ceva vreme: se lucra la acest proiect de peste 15 ani, iar in cursul timpului au aparut articole care prezentau rezultate intermediare. In plus, Venter nu a facut niciodata un secret din acest studiu. Chiar din contra, l-a prezentat cu emfaza, amanunte si – ar zice unii – cu aroganta, in desele si efervescentele sale iesiri publice.
2. Acum aproximativ doi ani, spre exemplu, a aparut un studiu extrem de important tot in Science (o revista careia Venter ii este credincios de cind a publicat, acum zece ani, varianta ‘sa’ a secventei genomului uman.
Articolul respectiv (Complete Chemical Synthesis, Assembly, and Cloning of a Mycoplasma genitalium Genome. Gibson et al. 2008.) raporta primul genom creat artificial. Acesta a fost intiiul si esentialul pas! S-a folosit bacteria cu cel mai mic genom cunoscut: are doar 485 de gene (comparativ, omul are putin peste 22ooo, iar orezul peste 50ooo). Dintre acestea probabil ca aproxiamtiv 100 nu sunt esentiale pentru supravietuire.
3. Pana acum singurele genomuri care au putut fi sintetizate artificial au fost cele de virusi, dat fiind ca sunt mult mai mici ca dimensiune. S-a inceput acum vreo zece ani cu crearea sintetica a virusului poliomelitei pornind de la secventa cunoscuta si reactanti care pot fi cumparati de pe piata.
Problema principala este ca ADN-ul este instabil atunci cind se incearca sintetizarea sa in segmente lungi. Cel mai mare genom confenctionat pana acum a fost de 32 kbp. M.genitalium are ~580 kbp., iar ADN-ul la dimensiunile acestea devine extrem de fragil. Pentru a reusi este nevoie ca sinteza sa fie facuta pe bucati.
4. Strategia a fost urmatoarea: casete de la 5-7 kb cu portiuni comune au fost sintetizate individual – adica s-a adugat consecutiv cite una, pina la o dimensiune la care lantul este inca stabil. Au fost apoi unite una cate una, succesiv, in grupuri totalizand 24, 72,144, 290, 580 kbp. Primii pasi au fost facuti in bacteria E. coli – un instrument extrem de utilizat in laborator pentru manevrarea materialulul genetic. Aceasta bacterie are enzime care uneste lanturi de ADN. Pentru ultimul pas, adica legatura a fost facuta in interiorul unei celule de drojdie care a unit ultimele bucati de genom intr-un unic lant de nucleotide.
5. Aveam asadar deja, la acea data, un cromozom artificial. Urmatorul pas logic era introducerea intr-o celula. Daca privim, genomul ca un simplu program de calculator care reprezinta informatia care produce proteinele necesare vietii intr-o celula, trebuia deci ca programul sa fie ‘instalat’ pe o masina si verificat daca functioneaza. Trebuie facuta legatura intre aceasta informatie (codata chimic) si materia prima biologica propriu zisa.
6. In studiul recent despre care vorbim (Creation of a Bacterial Cell Controlled by a Chemically Synthesized Genome, Gibson et al. Science, 2010) s-a folosit genomul bacteriei Mycoplasma mycoides (M. genitales crestea prea incet) si a fost implantat intr-o specie extrem de apropiata: Mycoplasma capricolum). Noua constructie creste si se inmulteste – este vie. In genomul sintetizat au fost dezafectatea 14 gene si au introdusa o secventa – analogul unui cod de bare – care sa certifice, odata genomul analizat, ca respectivul organism este creeat in laborator.
7. Codul acesta are si o parte nostima: contine patru indicii asupra originii sale umane. Spre exemplu, descrie un cod pentru a scrie cuvinte, propozitii si numere. Contine numele celor 46 de autori. Este scrisa chiar si o adresa la care cei care vor putea sa secventioneze intreg genomul sa poata trimite un mesaj. In plus, extrem de intersant sint prezente si trei citate celebre. Unul dintre acestea, datorat lui Richard Feyman spune: “nu pot sa inteleg ceva nu pot construi”.
8. Sa turnam insa putina apa rece peste acest rezultat. Daca continuam analogia celula – computer, DNA- program, putem sa spunem mai curind ca s-a folosit tehnica unui hacker. Venter nu a ‘creat’, ci doar a rescris un program cu mici schimbari intr-o zona in care a fost posibil.
De altfel, el a fost foarte clar intotdeauna asupra acestui aspect. In plus, recunoaste acelasi Venter, chiar cu schimbarile operate, nu este o vorba de noua specie, mai cuarind o noua tulpina a bacteriei a carui genom a fost folosit.
9. Evident marele premiu va fi modificarea unor parti ale genomului prin introducerea sau modificarea unor gene pentru a impinge metabolismul bacteriei intr-o anumita directie. Scopul final este construirea unor organisme artificiale. Sau mai precis modificarea unor organisme existente in asa fel incat sa poata fi folosite in alt scop.
Ar fi posibila construirea de bacterii artificiale capabile sa produca combustibili. O alta directie ar fi sintetizarea unor substante necesare industriei farmaceutice, substante care sunt prea scumpe in prezent, fie pentru ca extragerea lor pe cale naturala este foarte dificila, fie pentru ca sintetizarea lor pe cale artificiala este foarte costisitoare. S-ar putea produce rapid, precis si ieftin vaccinuri doar prin culturi de bacterii. Evident, Venter are deja contracte cu diferite companii pentru finalizarea acestor proiecte.
10. Probabil ca cele mai multe intrebari ridicate s-au referit la siguranta unei astfel de intreprinderi. Cum putem sti ca o astfel de forma de viata, odata iesita din laborator, nu va suferi mutatii care sa o transforme intr-un pericol public? Primul raspuns este simplu: toate aceste organisme sint construite in asa fel incit supravietuirea lor este conditionata de o substanta prezenta doar in laborator. In momentul cind ele ar parasi eprubetele in care au fost create, si-ar semna condamnarea la moarte.
Dar mai mult decit atit, orice modificare a unui organism are de obicei un efect negativ. Atunci cind sint schimbate secvente asupra carora evolutia a insistat milioane de ani, rezultatul nu poate fi pozitiv. In multe cazuri chiar, ceea ce se observa dupa o perioada de timp, este inregistrarea unor mutatii care aduc organismul la forma initiala. Exista un optim, spre care orice specie tinde. Astfel de constructii biologice, supravietuiesc doar intr-un mediu, atent, migalos si precis alcatuit in laborator.
Chiar si asa, riscurile nu pot fi cu totul inlaturate. Insa avantajele potentiale ale unei astfel de tehnologii compenseaza cu asupra de masura ipoteticele pericole. Nu putem renunta sa comercializam benzina pe motivul poate fi folosita in cocktailuri Molotov! Drumul deschis de astfel de experimente promite solutii pentru multe din marile probleme cu care omenirea se lupta in prezent. Fara a ignora posibilele amenintari, trebuie sa realizam ca ar putea fi reteta de a salva viata a sute de milioane de oameni si a imbunatati situatia a miliarde de oameni.
Progresul are un pret pe care il platim bucurosi de citeva secole. E adevarat insa ca, in fiecare care caz in parte, acest pret trebuie inteles in prealabil.
Etichete: biologie, celula artificiala, viata


Costi Rogozanu azi la 16:59 |
Cu Victor Ponta s-au strîns deja destule: rămîne principala problemă a noii legi electorale. [ citeste mai departe ]
Tudor Darie azi la 15:27 |
Așa a fost să fie ca eu să fiu persoana responsabilă din partea Guvernului pentru susținerea [ citeste mai departe ]
Iulian Leca azi la 15:15 |
Altfel, imi imaginez ca multi vor vota cu mana taiata. Ce vremuri.... macar odata cineva ameninta ca [ citeste mai departe ]
Laura Cernahoschi azi la 12:30 |
Update: Grăjdan a fost demis. De aici semnul întrebării din titlu. Oricum, încă o lovitură de [ citeste mai departe ]
Cristian Teodorescu azi la 10:16 |
A cotit cu dibăcie Băsescu la întrebarea ziariştilor dacă se mai întîlnesc cu el la [ citeste mai departe ]
Irina Zamfirescu 23 May la 16:13 |
Bucureștiul pare că ar fi inepuizabil. Construcții P+inifinit, spații verzi transformate în [ citeste mai departe ]
Mihai Goţiu 23 May la 15:30 |
Uninominalul pur, în forma adoptată ieri de Parlamentul României, e o mare mizerie. Argumentele [ citeste mai departe ]
Elena Vijulie 23 May la 14:29 |
Legea privind sistemul electoral majoritar uninominal a trecut ieri de Camera Deputaţilor, după ce [ citeste mai departe ]
Costi Rogozanu 23 May la 14:22 |
Ce e în neregulă cu POSDRU? Am tot fost avertizaţi că face Comisia Europeană verificări. [ citeste mai departe ]
Laura Cernahoschi 23 May la 12:10 |
Apare doar la emisiuni cu Gâdea, Alesandra Stoicescu sau duminicale de cancan, unde nu i se vor [ citeste mai departe ]
Cristian Teodorescu 23 May la 10:00 |
Uninominalul pur şi dur la care a visat Traian Băsescu pe vremea cînd era pe val s-ar putea [ citeste mai departe ]
Cristian Cojanu 23 May la 09:54 |
From Romania with Art,
25 mai, ora 21.30, Grădina Verona
Pe 25 mai, de Noaptea Albă a Galeriilor, [ citeste mai departe ]
Iulian Leca 23 May la 04:30 |
Cea mai mare critica adusa sistemului electoral ce tocmai a trecut si de Camera Deputatilor e ca [ citeste mai departe ]
Dorin Tudoran 22 May la 22:27 |
Prima lună de după o căsătorie este numită ”luna de miere”. Prima lună a [ citeste mai departe ]
Alin Fumurescu 22 May la 19:36 |
… s-au inmultit atacurile impotriva lui Basescu pe ultimul front ramas disponibil – [ citeste mai departe ]
Ciprian Şiulea 22 May la 18:11 |
Astăzi USL a demonstrat că tot ceea ce a spus în ultimii cîţiva ani împotriva PDL nu a fost [ citeste mai departe ]
Elena Vijulie 22 May la 14:19 |
Premierul Victor Ponta şi ministrul afacerilor europene Leonard Orban au anunţat ieri că [ citeste mai departe ]
Cristian Teodorescu 22 May la 12:06 |
Monica Macovei susţine că guvernul Ponta, despre care premierul spune că e cel mai curat, e cel [ citeste mai departe ]
Ciprian Domnişoru 22 May la 04:22 |
Întrebat despre participarea financiară a României la achiziționarea de către NATO a unor [ citeste mai departe ]
Costi Rogozanu 21 May la 21:55 |
Nişte fapte. Traian Băsescu s-a întîlnit ieri cu vice-preşedintele Chevron, compania care vrea [ citeste mai departe ]
Mihai Goţiu 21 May la 19:43 |
Nu mai e doar o impresie de început de campanie. Ci o confirmare: Emil Boc a evitat până în [ citeste mai departe ]
Constantin Creţan 21 May la 19:05 |
În ţara în care Eminescu, Creangă, Caragiale şi Preda n-au fost absolvenţi ai vreunei [ citeste mai departe ]
Cristian Teodorescu 21 May la 18:20 |
Useliştii au început ofensiva de vară puţintel mai devreme, presaţi de calendarul [ citeste mai departe ]
Costi Rogozanu 21 May la 15:38 |
Alegerea dintr-un tur a primarului generează tot felul de efecte secundare. De exemplu, negocierea [ citeste mai departe ]
Stelian Tănase 21 May la 12:17 |
Traian Băsescu aflat la Chicago, printre români, a profitat că se afla departe de casă şi [ citeste mai departe ]
Mihai Goţiu 21 May la 11:00 |
Am văzut și români care (încă) îl iubesc pe Traian Băsescu. E drept, nu în România. Trebuie [ citeste mai departe ]
Cristian Teodorescu 21 May la 10:03 |
Şi ducîndu-se dumnealui Traian sin Băsescu la sfat în cele străinătăţi l-au însoţit alai, [ citeste mai departe ]
Costi Rogozanu 20 May la 15:44 |
Săptămîna asta cele mai discutate probleme au fost cîinii vagabonţi, curăţenia oraşului, [ citeste mai departe ]
Constantin Creţan 20 May la 12:38 |
Fostul ministru german al apărării a ieşit din politică şi a pierdut titlul de doctor în urma [ citeste mai departe ]
Mihai Goţiu 20 May la 10:15 |
Înainte de începerea festivităților de lansare a candidaților USL la Consiliul Județean și [ citeste mai departe ]
| 1@Liicheanu si Plescu: Apropo...de ce îi recomanzi nepotului mărire alea ...alea,... tu le-ai făcut şi nu-ţi încapi în piele :twisted:... | ||
| 2@val_one: Prietene, nu-l confunda pe Rogo ... el e hidrantul numărul 1. Nu are treabă cu canalu'... | ||
| 3@tamara’s nephew: Mai onanist portocaliu,tu nu-ntelegi ca esti prost?Nu intelegi ca esti BUFONUL de pe Vox? Eu intru aici sa ma mai distrez,sa rad de voi,de proastele de udrea si anastase,de voi talmacenii... | ||
| 4@tamara's nephew: Ai o educatie puri securistica... Stilul UNGUReanului de la securitatea de stil nou ! Nu dovedesti a stii mai nimic, dar faci bancuri ! Esti superiorul, superiorului, capitalistul... | ||
| 5@roberta: Ce clone visezi fatoo? Sunt doar eu si nick-urile mele:mircea,val_one,macghita,talmacean,boc,udrea,anastase...... | ||
| 6@despre orice nu fi un spirit pecuniar! Plecarea ta de aici ar fi o "lipsa" substantiala!Sincer! Daca ai sti ce am de luat in Harghita,de pe urma bunicilor! Dar seful este Veresztoy!Da-i Cezarului,ce... | ||
| Mihai Goţiu 11503 citiri |
| Cristian Teodorescu 11431 citiri |
| Costi Rogozanu 10376 citiri |
| Ciprian Domnişoru 4343 citiri |
| Alin Fumurescu 4109 citiri |
| Constantin Creţan 3432 citiri |
| Iulian Leca 3323 citiri |
| Laura Cernahoschi 3263 citiri |
| Dorin Tudoran 2957 citiri |
| Elena Vijulie 2858 citiri |
| Cristian Teodorescu 8 postari |
| Costi Rogozanu 7 postari |
| Mihai Goţiu 7 postari |
| Constantin Creţan 4 postari |
| Ciprian Domnişoru 3 postari |
| Dorin Tudoran 3 postari |
| Iulian Leca 3 postari |
| Alin Fumurescu 3 postari |
| Elena Vijulie 2 postari |
| Laura Cernahoschi 2 postari |
| Mihai Goţiu 61895 citiri |
| Cristian Teodorescu 41771 citiri |
| Costi Rogozanu 39568 citiri |
| Ciprian Domnişoru 18391 citiri |
| Alin Fumurescu 18015 citiri |
| Viorel Dobran 12403 citiri |
| Dan Duca 11307 citiri |
| Constantin Creţan 11191 citiri |
| Iulian Leca 9585 citiri |
| Elena Vijulie 9483 citiri |
| Cristian Teodorescu 30 postari |
| Mihai Goţiu 29 postari |
| Costi Rogozanu 29 postari |
| Alin Fumurescu 11 postari |
| Constantin Creţan 10 postari |
| Ciprian Domnişoru 9 postari |
| Dorin Tudoran 8 postari |
| Dan Duca 8 postari |
| Ciprian Şiulea 7 postari |
| Iulian Leca 7 postari |
© 2009 VoxPublica.ro, o marca F5 Realitatea-Catavencu. Toate drepturile rezervate.
ADN – viata sintetica
muzica afro și
probleme de functionare la Facebook
Acestea sunt subiectele celor mai recente trei articole
aparute pe Vox Publica
Ele raspund limpede si indraznet
framantarilor Romaniei din aceste zile.
Banii n-au miros !
2010-05-27 06:33:03 | Raporteaza
…IN SCHIMB ALTI ȘOBOLANI TAC
Ultimul comentariu pe blogul lui TRAIAN UNGUREANU
dateaza din ZIUA BLESTEMTA : 6 mai 2010
Nu este totusi dedicata Magistralei Expuneri
prin care Traian Basescu a anuntat intrarea Romaniei in moarte clinica.
In ultima sa ”aparitie” TRU se mascase in ITM ….
…adica ne recomanda ”vinul zilei” Cianuloaica Roșie de Munte.
*
Greu moment.
Daca ar avea macar un nuron activ Ungureanu
ar realiza ca tacerea șui nu este un detergeny suficient
pentru a spala inscriptia MEGASLUGA A LUI BASESCU care
v-a ramane in veci lipita de finta-i.
*
Desi cuvantul DEMNITATE ii este strain…probabil ca
ar putea parea mai demn dac si-ar apara
idolul genocidian pana la capat.
Eventual daca i-ar pupa mana la scara helicopterului.
*
Dar Traian Ungureanu TACE SIMPTOMATIC.
*
Se poate insa si mai rau.
As fi uitat probabil ca Irina Schroter a lansat-o in viata publica
pe manechina peltica EBA.
Iata insa ca Irina , care nu avea nici o obligatie (sau avea ?)
a coborat in arena sa-l apere pe Basescu.
Si ca sa nu ne lase nici o urma de indoiala asupra
lipsei simtului sau de conservare
si-a dat gratios foc la valiza indemnandu-ne
pe noi cei carora ne fileaza necontenit o lampa
de la tragedia din decebrie 2009:
OBISNUITI-VA CU IDEEA CA BASESCU A CASTIGAT ALEGERILE
SI VA CONDUCE 5 ANI !
Eu cred ca va fi o mare bucurie printre doamnele detinute
de la Penitenciarul Targsor cand vor ajunge sa poarte
ZWGHE OTCUTUR croite de colega lor de suferinta.
*
Mai isteata: MACOVEI SURFISTA s-a gandit la o polita de asigurare
fara sa-l atinga totusi direct pe leul ranit.
Declaratia ei ca PDL ul fura si ca BOC STIE SI INGADUIE
este o buna baza
pentru a spune – DAR NUMAI CAND JOCURILE VOR FI FOST FACUTE –
ca SI BASESCU STIE SI INGADUIE.
2010-05-27 07:01:13 | Raporteaza
mihai2 : nu fi rau!
criza o sa tot fie si coruptie la fel.
pentru ca mi se pare ca in cazul asta merita.
mihnea: absolut extradordinar cum prezinti aici. multa munca sa intelegi ce se intampla, numai tu stii, multa munca sa rezumi sa intelegem, si fara sa scrii o carte intreaga. iaca te-am pupat si-n kur
2010-05-27 07:19:18 | Raporteaza
idei care mi se par misto in maintext, asa ca la shkoala
:
1 acum zece ani : crearea sintetica a virusului poliomelitei
2 bacteria E coli are enzime care uneste lanturi de ADN.
3 ADN-ul este instabil atunci cind se incearca sintetizarea sa in segmente lungi
4nu este o vorba de noua specie, mai curind o noua tulpina a bacteriei a carui genom a fost folosit
5 toate aceste organisme sint construite in asa fel incit supravietuirea lor este conditionata de o substanta prezenta doar in laborator
6 de urmarit: modificarea unor gene pentru a impinge metabolismul bacteriei intr-o anumita directie
2010-05-27 07:27:32 | Raporteaza
@ Mihnea – felicitari! E mare nevoie de asa ceva pe Vox.
2010-05-27 08:10:12 | Raporteaza
@M I H A I 2: Te invit să-ți tai venele. Pentru a nu părăsi ideea de postare pe teme științifice, am să-ți spun că secționarea lor transversală este practicată doar de către amatori sau falși sinucigași. Deci, taie-le longitudinal ca să fim siguri de succes.
PS. Unde naiba a dispărut AdCaptca?!
2010-05-27 10:51:55 | Raporteaza
Am sa-mi permit sa completez/explic eu ceea ce Mihnea a considerat a fi o noțiune cunoscuta de toată lumea: kpb
- O pentoza (moleculă ciclică cu 5 atomi de carbon) + o bază azotată = nucleosidă.
- Pentoza fosforilată (un atom de fosfor prin care se face legatura cu următoarea pentoză din șir) + o bază azotată = nucleotidă.
- Nucleotidele dintr-un șir sunt legate complementar, în pereche, de nucleotidele celuilalt șir prin punți de hidrogen, formând dublul helix. ADN este un polimer.
Putem spune că el este o succesiune de perechi de nucleotide.
- KBP = kilo-base pair. Așadar, Mycoplasma genitalium are 580000 de perechi de nucleotide.
2010-05-27 11:48:24 | Raporteaza
Ioi, ioi, ioi! Vine sfarsitul lumii! Va substituiti Creatorului! Pentru a evita blasfemia, trimiteti cate 100 de euro in contul meu, sa lupt impotriva lor!!! Acum serios, ce mare scofala prezinta Nature? Ce naiba de viata artificiala? Si eu pot face un calculator functional, cu piesele de la un calculator functional dezmembrat! Este simpla inginerie genetica, cu material preformat, ceea ce face Venter! Recunosc, e revolutionara metoda de “lipire” a secventelor nucleotidice, dar tot nu rezolva problema instabilitatii moleculelor ADN mari!
2010-05-27 12:03:55 | Raporteaza
@Bref: Recunosc ca nici pe mine nu m-a dat pe spate chestia asta, dar este ceva mai complicată decât asamblarea unui computer din piesele componente. Ar fi similar doar dacă ai recompune procesorul, placa de bază, placa video… din microcomponente.
Tocmai zisei că ADN nu este o moleculă ci un polimer.
Tu de ce crezi că s-a orientat Venter spre cel mai simplu genom cunoscut? Și pe ăsta a fost nevoit să-l construiască din module. Mai este mult până departe. Cromozomii sunt structuri cu mult mai complexe decât ADN-ul pe care-l conțin, iar în stare naturală ADN este foarte stabil; se poate preleva și după zeci sau sute de ani, dacă n-a trecut prin foc și sabie
P.S. Vai ce bine-i fără captcha!
2010-05-27 14:24:12 | Raporteaza
@marius v:
merci de precizari. oricum textul era mult prea lung si n-am vrut sa extra-exagerez.
Venter a cautat mult bacteria cu cel mai mic genom.
Ideea era sa fie gasita forma de viata cu genom minim, pentru ca mai apoi sa poata fi adaugate alte pathwayuri.
In plus, era si o intrbare interesanta: care e numarul de gene minim necesar vietii?
2010-05-27 15:53:16 | Raporteaza
Pe de altă parte, din moment ce definirea vieții ține mai mult de filosofie decât de biologie (de dezvoltare – metabolism – reproducere ar fi în stare și entitățile cibernetice, la o adică), cred că adevăratul challenge ar fi înțelegerea modului în care interacționează genele și predictibilitatea expresiei unei gene, mai ales în funcție de locusul în care este plasată.
2010-05-27 16:58:16 | Raporteaza
Felicitari pentru articol! E nevoie ca de aer de astfel de scrieri in Romania.
2010-05-28 11:14:44 | Raporteaza
Fain articol, multumesc. Ce inseamna kbp?
2010-05-28 17:03:57 | Raporteaza